Egentlig var det en melleminstans i den preussiske administration med sæde i Slesvig, men samtidig det højeste trin i det preussiske forvaltningssystem. Statsamtmanden havde direkte kontakt med de preussiske ministerier. Underordnet ham var amtmændene og overborgmestrene, politiet, skolerådene og andre myndigheder. Statsamtmanden, amtmændene og den provinsielle selvadministration var de tre søjler i den prøjsiske provinsforvaltning. Forholdet mellem overpræsidenten og statsamtmanden var ikke formelt defineret, og selvom overpræsidenten skulle føre tilsyn med statsamtmanden, havde han ikke bemyndigelse til at udstede ordrer.